酚氯仿法提取DN蛀要步骤和原理酚氯仿法提取DNA主要步骤：将动物组织放在1.5ml的离心管中，分别用75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。每个梯度脱水时间为5-10min将组织放入研钵中，加入适量DNA裂解液（300a）,研磨后再加入300aIDNA裂解液冲洗研磨将研磨好的组织液用移液枪加到1.5ml离心管，在管中加10al蛋白酶K，用封口带将离心管封口，放入摇床（56C,5h）。加入等体积的Tris饱和酚（500a）,摇匀（10min）。离心：12000R,7min,4C。离心后分成上中下三层，上层为DNA，中层为蛋白质，下层为有机质。配制Tris饱和酚：氯仿：异戊醇=25:24:1。在含有上清液的离心管中加入Tris饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450a,摇匀10min。离心：12000R,7min,4C。吸取上清液加到新的离心管，加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400a1氯仿：异戊醇=24:1）。吸取上清液加入新的离心管，加入2.5倍经过-20C冷冻的100%的酒精。-20C过夜。10.将样品取出，12000R,7min,4C离心。11.弃上清，留白色沉淀（DNA），加400卩的75%的经过-20C冷冻的酒精，反复吹打溶解。12.重复第14步骤2次（用75%酒精洗三次）。13.提取DNA完成。溴氯仿法提取DNA的原理：用酚抽提细胞DNA时，有什么作用？使蛋白质变性，同时抑制了DNase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时，由于蛋白与DNA联结键已断，蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相，而DNA溶于水相。使用酚的优点：1.有效变性蛋白质；2.抑制了DNase的降解作用。缺点：1.能溶解10-15%的水，从而溶解一部分poly（A）RNA。2.不能完全抑制RNase的活性。氯仿的作用？氯仿：克服酚的缺点；加速有机相与液相分层。最后用氯仿抽提：去除核酸溶液中的迹量酚。（酚易溶于氯仿中）用酚－氯仿抽提细胞基因组DNA时，通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇，为什么？异戊醇：减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力，从而减少气泡产生。另外，异戊醇有助于分相，使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。用乙醇沉淀DNA时，为什么加入单价的阳离子？用乙醇沉淀DNA时，通常要在溶液中加入单价的阳离子，女口NaCI或NaAc,Na+中和DNA分子上的负电荷，减少DNA分子之间的同性电荷相斥力，而易于聚集沉淀。原理：动物和植物组织的脱氧核糖核蛋白（DNP）可溶于水或浓盐溶液（如1moI/L氯化钠），但在0.14moI/L氯化钠盐溶液中溶解度最低，而核酸核蛋白（RNP）则在0.14moI/L氯化钠中溶解度最大，利用这一性质可将其分开。将沉淀物溶解于生理盐水，加入去污剂十二烷基硫酸钠（SDS）溶液，使DNA与蛋白质分离开。加入固体氯化钠使其浓度达到1mol/L，使DNA溶解。加氯仿-异戊醇去除蛋白质，也可重复该步操作得较纯DNA。最后用95%乙醇沉淀DNA。溶解：将离心后除去RNA的沉淀，用30ml生理盐水溶解，充分搅拌后，匀浆一毫升10%SDS溶液，使溶液的SDS浓度达到1%左右，边加边搅拌，放置60C水浴保温10分钟（不停搅拌），冷却。加固体氯化钠，使溶液氯化钠浓度达到1mol/L，充分搅拌10分钟；除杂质：加等体积氯仿-异戊醇混合液，充分震荡10分钟，8000r/min离心7分钟，取上层液量好体积，倒入烧杯中（离心管），加同体积的氯仿-异戊醇混合液，重复上次操作。直至界面不出现蛋白凝胶为止；沉淀：准确量取上清液体积，倍体积95%冷乙醇，搅拌后，置冰箱静止冷却，待有白色丝状物出现，约10-15分钟，离心8000r/min离心7分钟，得白色沉淀；溶解：将沉淀物用0.1mol/LNaOH约10毫升溶解,得DNA溶液。溶液I—溶菌液：溶菌酶：它是糖苷水解酶，能水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的3-1,4糖苷键，因而具有溶菌的作用。当溶液中pH时，溶菌酶作用受到抑制。葡萄糖：增加溶液的粘度，维持渗透压，防止DNA受机械剪切力作用而降解。EDTA：（1）螯合Mg2+、Ca2+等金属离子，抑制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用（DNase作用时需要一定的金属离子作辅基）;（2）EDTA的存在，有利于溶菌酶的作用，因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。溶液II—NaOH—SDS液：NaOH:核酸在pH大于5，小于9的溶液中，是稳定的。但当pH12或pH3NaOH浓度为0.2mo1/L,加抽提液时，该系统的pH高达12.6,因而促使染色体DNA与质粒DNA的变性。SDS：SDS是离子型表面活性剂。它主要功能有：（1）溶解细胞膜上的脂质与蛋白，因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜。（2）解聚细胞中的核蛋白。（3）SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-…R+-蛋白质的复合物，使蛋白质变性而沉淀下来。但是SDS抑制核糖核酸酶的作用，所以在以后的提取过程中，必须把它去除干净，防止在下一步操作中(用RNase去除RNA时)受到干扰。溶液lll--3mol/LNaAc(pH4.8)溶液：NaAc的水溶液呈碱性，为了调节pH至4.8，必须加入大量的冰醋酸。所以该溶液实际上是NaAc-HAc缓冲液。用pH4.8的NaAc溶液是为了把pH12.6抽提液，调回pH至中性，使变性的质粒DNA能够复性，并能稳定存在。而高盐的3mol／LNaAc有利于变性的大分子染色体DNA、RNA以及SDS-蛋白复合物凝聚而沉淀之。前者是因为中和核酸上的电荷，减少相斥力而互相聚合，后者是因为钠盐与SDS—蛋白复合物作用后，能形成较小的钠盐形式复合物，使沉淀更完为什么用无水乙醇沉淀DNA？用无水乙醇沉淀DNA，这是实验中最常用的沉淀DNA的方法。乙醇的优点是可以任意比和水相混溶，乙醇与核酸不会起任何化学反应，对DNA很安全，因此是理想的沉淀剂。DNA溶液是DNA以水合状态稳定存在，当加入乙醇时，乙醇会夺去DNA周围的水分子，使DNA失水而易于聚合。一般实验中，是加2倍体积的无水乙醇与DNA相混合，其乙醇的最终含量占67％左右。因而也可改用95％乙醇来替代无水乙醇（因为无水乙醇的价格远远比95％乙醇昂贵）。但是加95％的乙醇使总体积增大，而DNA在溶液中有一定程度的溶解，因而DNA损失也增大，尤其用多次乙醇沉淀时，就会影响收得率。折中的做法是初次沉淀DNA时可用95％乙醇代替无水乙酵，最后的沉淀步骤要使用无水乙醇。也可以用0.6倍体积的异丙醇选择性沉淀DNA。一般在室温下放置15－30钟即可。在用乙醇沉淀DNA时，为什么一定要加NaAc或NaCI至最终浓度达0.1〜0.25mol/L?在pH左右的溶液中，DNA分子是带负电荷的，加一定浓度的NaAcNaCI，使Na+中和DNA分子上的负电荷，减少DNA分子之间的同性电荷相斥力，易于互相聚合而形成 DNA钠盐沉淀，当加入的盐溶液浓度太低时，只有部 分DNA形成DNA钠盐而聚合，这样就造成DNA沉 淀不完全，当加入的盐溶液浓度太高时，其效果也不好。 在沉淀的DNA中，由于过多的盐杂质存在，影响DNA 的酶切等反应，必须要进行洗涤或重沉淀。 加核糖核酸酶降解核糖核酸后，为什么再要用SDS KAc来处理？加进去的RNase 本身是一种蛋白质，为 了纯化DNA，又必须去除之，加SDS 可使它们成为 SDS-蛋白复合物沉淀，再加KAc 使这些复合物转变为 溶解度更小的钾盐形式的SDS-蛋白质复合物，使沉淀 更加完全。也可用饱和酚、氯仿抽提再沉淀，去除 RNase。在溶液中，有人以KAc 代替NaAc，也可以 收到较好效果。 7．为什么在保存或抽提DNA过程中，一般采用TE 冲液？在基因操作实验中，选择缓冲液的主要原则是考虑DNA的稳定性及缓冲液成分不产生干扰作用。磷酸 盐缓冲系统(pKa=7.2)和硼酸系统(pKa=9.24)等虽然 也都符合细胞内环境的生理范围(pH)，可作DNA的保 存液，但在转化实验时，磷酸根离子的种类及数量将与 Ca2＋产生Ca3(PO4)2 沉淀；在DNA 反应时，不同 的酶对辅助因子的种类及数量要求不同，有的要求高离 子浓度，有的则要求低盐浓度，采用Tris-HCI(pKa=8.0) 的缓冲系统，由于缓冲液是TrisH+/Tris，不存在金属 离子的干扰作用，故在提取或保存DNA时，大都采用 Tris-HCl 系统，而TE 缓冲液中的EDTA更能稳苯酚、 氯仿、异戊醇在DNA提取时的作用抽提DNA去除蛋 白质时，怎样使用酚与氯仿较好？酚与氯仿是非极性分 子，水是极性分子，当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时， 蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去，使蛋白失 去水合状态而变性。经过离心，变性蛋白质的密度比水 的密度为大，因而与水相分离，沉淀在水相下面，从而 与溶解在水相中的DNA分开。而酚与氯仿有机溶剂比 重更大，保留在最下层。作为表面变性的酚与氯仿，在 去除蛋白质的作用中，各有利弊，酚的变性作用大，但 酚与水相有一定程度的互溶，大约10%〜15%的水溶解 在酚相中，因而损失了这部分水相中的DNA，而氯仿 的变性作用不如酚效果好，但氯仿与水不相混溶，不会 带走DNA。所以在抽提过程中，混合使用酚与氯仿效 果最好。经酚第一次抽提后的水相中有残留的酚，由于 酚与氯仿是互溶的，可用氯仿第二次变性蛋白质，此时 一起将酚带走。也可以在第二次抽提时，将酚与氯仿混 合（1:1）使用。为什么用酚与氯仿抽提DNA时，还 在抽提DNA时，为了混合均匀，必须剧烈振荡容器数次，这时在混合液内易产生气泡，气泡会阻止相互间的 充分作用。加入异戊醇能降低分子表面张力，所以能减 少抽提过程中的泡沫产生。一般采用氯仿与异戊酵为 24：1 之比。也可采用酚、氯仿与异戊醇之比为25： 24:1（不必先配制，可在临用前把一份酚加一份24：1 的氯仿与异戊醇即成），同时异戊醇有助于分相，使离 心后的上层水相，中层变性蛋白相以及下层有机溶剂相 维持稳定。 苯酚：氯仿：异戊醇为什么要25:24:1？抽提DNA去 除蛋白质时，怎样使用酚与氯仿较好？酚与氯仿是非极 性分子，水是极性分子，当蛋白水溶液与酚或氯仿混合 时，蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去，使蛋 白失去水合状态而变性。经过离心，变性蛋白质的密度 比水的密度为大，因而与水相分离，沉淀在水相下面， 从而与溶解在水相中的DNA分开。而酚与氯仿有机溶 剂比重更大，保留在最下层。作为表面变性的酚与氯仿， 在去除蛋白质的作用中，各有利弊，酚的变性作用大， 但酚与水相有一定程度的互溶，大约10%〜15%的水溶 解在酚相中，因而损失了这部分水相中的DNA，而氯 仿的变性作用不如酚效果好，但氯仿与水不相混溶，不 会带走DNA。所以在抽提过程中，混合使用酚与氯仿 效果最好。经酚第一次抽提后的水相中有残留的酚，由 于酚与氯仿是互溶的，可用氯仿第二次变性蛋白质，此 时一起将酚带走。也可以在第二次抽提时，将酚与氯仿 混合（1:1）使用。为什么用酚与氯仿抽提DNA时， 还要加少量的异戊酵？在抽提DNA时，为了混合均匀， 必须剧烈振荡容器数次，这时在混合液内易产生气泡， 气泡会阻止相互间的充分作用。加入异戊醇能降低分子 表面张力，所以能减少抽提过程中的泡沫产生。一般采 用氯仿与异戊酵为24：1 之比。也可采用酚、氯仿与 异戊醇之比为25：24:1（不必先配制，可在临用前把 一份酚加一份24：1 的氯仿与异戊醇即成），同时异 戊醇有助于分相，使离心后的上层水相，中层变性蛋白 相以及下层有机溶剂相维持稳定。